2019年11月25日傍晚，教宗方濟各在日本首相官邸私下拜訪了該國首相安倍晉三，然後會見日本當局和外交使團，這是他當天訪問行程中的最後一項活動。教宗在講話中強調對話、和平與正義的價值、關懷被排斥和被遺忘的人、維護生命，以及尊重人類家庭成員的尊嚴與權利。

教宗首先闡明他來日本訪問的目的是「為堅固日本天主教徒的信仰，肯定他們對有需要者的愛德善舉和為自己感到自豪的國家提供的服務」。他提到聖座與日本交往的深厚友誼，這是初期傳教士尊重和讚賞這個國家的果實，正如耶穌會遠東傳教區視察員范禮安（Alessandro Valignano）神父所言:「若想看到上主賜予人類的一切，來到日本看看便足矣。」

教宗盛讚這個國家格外關注不幸和殘疾人士的痛苦，他此行的格言「保護所有生命」表明承認生命「不可侵犯的尊嚴」，以及在任何情況下「關懷和扶持我們弟兄姐妹的重要性」。

接著，教宗談到和平議題，指出:「歷史告訴我們，即使是最嚴重的民族與國家之間的衝突也只能透過對話找到有效的解決之道。對話是相稱於人類的唯一武器，能確保持久的和平。相遇和對話的文化對建設一個更公正和更友愛的世界至關重要，這是智慧和具有寬闊視野的特徵。日本認識到在教育、文化、體育和觀光領域促進人際交往的重要性，懂得這樣做能對建設和平的基礎，即和諧、正義、互助與修和作出極大貢獻。」

教宗提到今年2月他在阿布扎比與阿玆哈爾大伊瑪目簽署的《人類兄弟情誼文件》，稱之為「採取交談文化之途徑，以相互合作為行動準則，以彼此了解為方法和標準」的指路明燈。事實上，「不同宗教之間的良好關係不僅對於和平的未來至關重要，也對培養今日和未來世代的人是必不可少的，他們應珍視那些作為真正公正和人性社會基礎的道德原則。」

教宗強調:「在面對受造界議題時，青年要求我們以事實而非幻想作出真正的回應。日本的櫻花美麗且脆弱，這個特性也提醒我們共同家園的脆弱性，它不僅受到自然災難的襲擊，也因人手造成的貪婪、剝削和蹂躪而被摧毀。每當國際社會難以遵守自己為保護受造界作出的承諾時，是青年在呼籲和要求作出勇敢的決定。」

保護共同家園也意味著關注人類生態學，面對在以冷漠為標記的全球經濟體系中富人與窮人之間的差距。教宗感謝日本政府在這方面付出的努力，鼓勵該國繼續培養和增進各國之間共同負責的意識。教宗表示:「人的尊嚴必須成為一切社會、經濟和政治活動的中心，必須促進代際之間的團結互助，在團體生活的各個層面需要關注那些被遺忘和被排斥的人。」

教宗最後鼓勵日本全國人民更加努力保護生命，尊重人類大家庭每位成員的尊嚴和權利。