自從基督信仰誕生之初，在美索不達米亞就有基督徒的臨在，這在《宗徒大事錄》中也提到。根據傳統，藉著聖多默和他弟子們的宣講，基督信仰在公元第一世紀就在這片土地上傳揚，並蔓延到東亞地區。對所有基督徒而言，伊拉克因其文化和宗教上的富饒，因此在聖經和歷史上是一個重要地區。

今天，當地基督徒團體分為加色丁禮、敘利亞禮、亞美尼亞禮、梅爾基蒂禮、正教和新教團體。隨著伊斯蘭的來到，以及伊拉克獨立後，這些團體的信仰生活一直受到迫害和歧視。薩達姆·侯賽因建立了非宗教政權，允許基督信仰教會在社會-愛德園地從事服務，儘管教會學校被國有化，對基督徒的歧視仍舊存在。

在薩達姆執政期間，因接二連三的戰爭，基督徒從廿世紀80年代起便開始向外移民，而且逐漸增加。因此，衆多的伊拉克基督徒團體在國外形成，而提供靈性幫助和保護他們文化認同的問題也應運而生。這個問題在加色丁教會内尤其感到有其必要。

2003年的戰爭，以及2014年至2017年自稱的伊斯蘭國占據北部後，不安全、暴行和兇殺迫使更多的基督徒離開伊拉克。第二次波斯灣戰爭前夕，在伊拉克的基督徒大約有1百萬到140萬，佔全國人口的6%。從那時起，基督徒的臨在大幅減少，據“援助苦難教會”（ACS）組織近期的統計，目前當地只剩下30-40萬基督徒。

此外，僅在2003年至2015年3月，就有1200名基督徒被殺害，其中包括加色丁禮摩蘇爾的總主教拉奧（Paulos Rahho），以及在聖戰組織兇殺中喪生的5位司鐸和48名信徒。美索不達米亞地區基督信仰的歷史性搖籃，尼尼微平原被伊斯蘭國占據後，便徹底抽空了基督徒在這個地區的臨在。

10萬多基督徒和其他受到迫害的少數群體，如亞兹迪人被迫離開家園，他們中的許多家庭在伊拉克庫爾德斯坦、約旦、敘利亞、土耳其和黎巴嫩找到避難所，或是到歐洲及其它大陸尋求避難。最近幾年，至少5萬5千名基督徒也離開了伊拉克庫爾德斯坦。聖戰組織還狂怒地摧毀或嚴重迫壞了基督徒的聖堂和他們的產業。

可慶幸的是，從2019年1月起，加色丁禮摩蘇爾總主教穆薩（Najib Mikhael Moussa）救回一部分基督信仰重要的歷史財產，其中包括公元13到19世紀深具歷史意義的手抄本。為此，他於2020年榮獲歐盟頒發的薩哈羅夫獎。

2017年，伊斯蘭國哈里發在伊拉克潰敗後，在普世教會，尤其是「援助苦難教會」宗座基金會的幫助下，基督徒開始緩慢地返回尼尼微平原。這個基金會正在重建被摧毀的房屋和聖堂，提供社會和教育領域的支持。到2020年11月為止，幾乎半數的基督徒回到尼尼微，平原上80%的聖堂處於重建階段。如今，這個地區基督徒家庭被損壞的大約57%的住宅已經修復完畢。

雖然如此，許多人因尚存在的困難和恐懼仍不敢返回伊拉克。缺乏安全、武裝和敵對組織的騷擾、恐嚇和敲詐金錢對伊拉克基督徒團體繼續是一種實際的威脅，尼尼微地區尤其如此。根據《伊斯蘭國之後的生活》（Life after Isis）網站的報告，造成這些恐怖活動的，主要是當地親近伊朗的什葉派“人民動員”（Hashd al-Shaabi）組織，以及屬於沙巴克少數民族和宗教團體的組織（Hashd al-Shabak）。