同全世界各國領導人一樣，教宗方濟各對日本前首相安倍晉三遇害身亡的事件表示悲痛，稱刺殺的舉動是毫無意義的暴行。2022年7月9日，教宗透過聖座國務卿帕羅林樞機拍發唁電給聖座駐日本大使博卡爾迪（Leo Boccardi）總主教，請他向安倍晉三的親屬轉達哀悼之意。

這位日本前首相2022年7月8日在街頭競選集會上發表演講時遭一名男子槍擊，不治身亡。教宗的唁電是對日本全國人民的關懷和安慰，他祝願該國社會「加强為和平及非暴力進行的歷史性努力」。